Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Cntnap5cQ0V8T7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Cntnap5cQ0V8T7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Cntnap5cQ0V8T7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Cntnap5cQ0V8T7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Cntnap5cQ0V8T7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Cntnap5cQ0V8T7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Cntnap5cQ0V8T7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cntnap5cQ0V8T7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cntnap5cQ0V8T7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cntnap5cQ0V8T7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cntnap5cQ0V8T7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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