Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms