Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Col17a1Q07563 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col17a1Q07563 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms