Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms