Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms