Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rcn1Q05186 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rcn1Q05186 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rcn1Q05186 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms