Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms