Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms