Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms