Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms