Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms