Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Mmp11Q02853 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Mmp11Q02853 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mmp11Q02853 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mmp11Q02853 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mmp11Q02853 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mmp11Q02853 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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