Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms