Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms