Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms