Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GscQ02591 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GscQ02591 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GscQ02591 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GscQ02591 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GscQ02591 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GscQ02591 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GscQ02591 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GscQ02591 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GscQ02591 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GscQ02591 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GscQ02591 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GscQ02591 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GscQ02591 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GscQ02591 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GscQ02591 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GscQ02591 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GscQ02591 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GscQ02591 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GscQ02591 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GscQ02591 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GscQ02591 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GscQ02591 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GscQ02591 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GscQ02591 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GscQ02591 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GscQ02591 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GscQ02591 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GscQ02591 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GscQ02591 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GscQ02591 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GscQ02591 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GscQ02591 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GscQ02591 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GscQ02591 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GscQ02591 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GscQ02591 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GscQ02591 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms