Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms