Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms