Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms