Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms