Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms