Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms