Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms