Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme1P97371 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme1P97371 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme1P97371 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme1P97371 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psme1P97371 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms