Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms