Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms