Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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