Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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SgcgP82348 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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SgcgP82348 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SgcgP82348 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SgcgP82348 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SgcgP82348 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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