Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms