Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx3P81067 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx3P81067 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms