Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NficP70255 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NficP70255 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NficP70255 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NficP70255 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NficP70255 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NficP70255 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NficP70255 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NficP70255 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NficP70255 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NficP70255 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NficP70255 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NficP70255 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NficP70255 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NficP70255 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NficP70255 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NficP70255 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NficP70255 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NficP70255 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NficP70255 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NficP70255 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NficP70255 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NficP70255 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NficP70255 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms