Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Hoxd13P70217 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Hoxd13P70217 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Hoxd13P70217 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hoxd13P70217 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hoxd13P70217 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hoxd13P70217 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hoxd13P70217 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hoxd13P70217 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Hoxd13P70217 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms