Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms