Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms