Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms