Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms