Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp4P59240 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp4P59240 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp4P59240 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp4P59240 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp4P59240 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp4P59240 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp4P59240 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp4P59240 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp4P59240 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms