Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms