Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms