Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tpm2P58774 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms