Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms