Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SmoP56726 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmoP56726 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms