Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms