Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Faf1P54731 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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Faf1P54731 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Faf1P54731 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Faf1P54731 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Faf1P54731 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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