Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms