Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms