Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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