Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms