Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CitP49025 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CitP49025 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CitP49025 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CitP49025 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CitP49025 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CitP49025 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CitP49025 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CitP49025 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CitP49025 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CitP49025 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CitP49025 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CitP49025 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CitP49025 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CitP49025 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CitP49025 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CitP49025 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CitP49025 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CitP49025 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CitP49025 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CitP49025 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CitP49025 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CitP49025 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CitP49025 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CitP49025 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CitP49025 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CitP49025 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CitP49025 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CitP49025 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms