Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms